历届政协主席为地球所有已知生物DNA测序~omg-寒子姐姐

    为地球所有已知生物DNA测序~omg-寒子姐姐

    2015年11月,由23个生物学大佬组成的委员会 在华盛顿史密森学会(Smithsonian Institution)会晤。
    他们有一个十分宏伟(其实是浮夸)的计划美人图风中啸。

    智人(Homo sapiens)的完整基因组测序已经发布12年了。
    在此期间,其他有机体的基因组破译工程也在缓慢进行。
    有些有机体预测性较高我的贤者大人,一次性就能破译,比如蜜蜂、鸡、和米...
    而有些就没那么容易了。
    比如脊椎动物、昆虫还有蛛形纲动物(包括蜘蛛、鞋子、螨和蜱)这几个群体,种类繁多,有几千种,光是取样就十分困难。
    所以进展极其缓慢。
    委员会的这项浮夸的计划就是,要将地球上所有的复杂生命进行DNA测序,并将其命名为地球生命测序工程(Earth BioGenome Project, EBP)

    与此同时,有一位住在巴西的秘鲁企业家,也有一个大胆的计划。
    Juan Carlos Castilla Rubio (以下简称Juan)打算将原本依靠采矿业、伐木业、放牧业的亚马逊流域,转变成开发研究生命有机体与生物信息的大本营,基于其得天独厚的地理条件。
    曾经至少有两次,亚马逊流域依靠其有机体形成了相关经济产业,带来几十亿美元收入。
    比如橡胶树的采伐,再比如从蛇液中提取出的血管收缩转化酶抑制剂(ACE inhibitor)等。
    Juan认为,如果今天能够更进一步了解雨林中的生命信息,未来将带来更多的类似以上这样的机遇。
    他声称,想要实现这个新经济体,对于那些住在亚马逊流域的居民以及管理该区域的人来说,需要共同分享利益。
    首先他们必须想出一个办法,避免出现与橡胶树、ACE相同的问题三重缓冲,即外商在无开采权的情况下集资开发,且不对当地政府上交税收。
    Juan保护原产国的想法并不是独一无二的。
    一个叫《名古屋议定书》的国际协议(Nagoya Protocol) 给能够开采生物材料的原产国给予了法律权利。该协议规定,如果在某一国家领地中收集了样本,需经过该国同意。
    Juan明白,如果真的要推进这项研究,将知识变为财富, 监管部门一定会插足;
    所以他在考虑如何建设一个亚马逊生物信息(主要是DNA测序信息)的开放性图书馆,这样就可以跟踪谁用了这些信息做了什么研究,从而带来商业价值;
    他把自己的想法命名为亚马逊代码银行;(Amazon Bank of Codes)
    如今,随着达沃斯世界经济论坛的召开,这两个想法撞到了一起烽烟狼卷。
    1月23日,论坛宣布EBP将会协助亚马逊代码银行收集储存信息数据成也萧何。
    论坛还表示,将会为该计划争取出席论坛的世界顶级风云人物的(资金上的)支持。
    Branching out
    EBP表示龙翔九洲 ,他们第一个目标是在十年内,完成150万已知的真核生物的基因测序工程。
    真核生物是细胞中含有真核的有机体,也就是动植物、真菌类还有被称作为原生生物的单细胞有机物... ( 没有真核的有机体,比如细菌和古生物,就留给别人代劳测序了)
    他们的目标分三个阶段。
    第一阶段:前三年会用来破译真核细胞科(Family)的每一位成员的DNA,
    在生物分类学中星咲优菜,属(Genus)隶于科(Family)。
    真核细胞科中有大约9300属;
    【分类学 从大到小: 域(Domain)、界(Kingdom)、门(Phylum)、纲(Class)、目(Order)、科(Family)属(Genus)、种(Species)】
    【比如狐狸(Species),狐属(Genus),犬科(Family),食肉目(order)、哺乳纲(Class)】
    【再比如文章开头提到过的智人Homo sapiens(就是咱们,一种Species),人属(Genus)玩尽杀绝4,人科(Family),灵长目(order)、哺乳纲(Class)、脊索动物门(Phylum)、动物界(Kingdom)】
    第二阶段:接下来的三年致力于破译15万真核细胞属(Genus)的一种(Species)
    【这句实在不懂啥意思= =】
    The subsequent three years would be devoted to creating rougher sequences of one species from each of the 150,000 or so eukaryotic genera.
    第三步:剩下的四年计划破译剩下的种。
    【orz 生物极差的我尽力了= =】
    这个计划非常有挑战性烟斗村。
    第一阶段意味着每天需破译超过8个基因组;
    第二阶段差不多每天140个,
    第三阶段则是超过1000个。
    作为对比,目前已经破译的真核细胞大约仅有2500个。
    :)
    光是这些数字就让人望而生畏了婚姻反击战,,
    但这还不是该计划的困难之处。
    真正难点在于是否有足够资金购买测序机器和招聘技术人员?
    当然啦,还有测序样本收集也极可能拖慢这个计划的进展。
    作为EBP的创始人之一,加利福尼亚大学的基因专家Harris Lewin预测,提取一个高质量的新物种的基因数据需要大约4-6万美元的成本,包括劳动力、机器、试剂等。
    (omg太贵了吧)
    因此要完成整个科的测序,利索夫斯基大约需要5亿美元。
    世界上的其他几个大型基因测序中心实习天使,比如中国的华大基因(BGI),美国的洛克菲勒大学的基因资源中心、英国的桑格研究所(Sanger Institute) 还有其他的小组织威海潮汐表, 都想要分一杯羹。
    BGI把加利福利亚的创业公司Complete Genomics买了下来,
    这个公司认为它能够把测序成本降到$100美元(和上面那个专家预测差距也太大了把!)
    英国公司Oxford Nanopore认为他们也可以做到,并且能将该技术发展成便携式技术大商道。(意思就是随时拎个设备就能出去采样拿到DNA信息? )
    还有一个困难之处是,
    这些标本的集合问题。。
    假如有50万种标本来自植物园、动物园或者美国国立博物馆(Smithsonian,据说有30万种植物标本),那么剩下的肯定是从野外收集的蜡笔团 。
    Lewin博士希望这个工程能够激发收集与处理的创新。
    比如可以结合传统方式(征募众多市民科学家收集样本)与新科技(比如无人机)。
    【反正我没懂t_t】
    这听起来确实需要好几十年的努力。
    《民古屋议定书》规定,如果在某一国家领地中收集了样本,需经过该国同意。对资本家来说这是一个噩耗空空歌 ,
    EBP的另一创始人John Kress教授表示,许多测序公司都栽倒在这里...
    这也是EBP为什么想要吸收Juan和他的代码银行作为新成员。(因为这个代码银行的大本营就是有丰富资源的亚马逊流域 不需要考虑争取同意这件事!)
    Banking on it
    区块链技术因比特币及其他虚拟货币而被大众熟知,
    但该技术不仅仅只有这一个用途。
    建立代码银行的想法是,利用区块链建立生物信息数据库;
    具体来说,区块链技术可以用来创建‘智能合同’,监测并执行该合同。
    想要获得Juan的代码银行数据,就意味着需要进入这样一份合同,
    银行可以跟踪该数据的用途。
    如果是商业用途,会自动付款给该数据的指定拥有人。。
    Juan表示希望能在几个月内建好这样的平台。。。
    理论上,这样的智能合同可以使政府感到安宁,不需再担心生物剽窃问题;还可以鼓励人们使用这些数据做实验。
    在Juan的眼里,基因数据还只是一个开始,
    他认为亚马逊代码银行最终会包含所有生物化合物信息芭妮兰官网,比如从蛇液中萃取出的ACE血管收缩转化酶抑制剂,还有整齐划一的蚂蚁军队,该行为特征启发了自动驾驶汽车队伍的算法规则。。
    他最终的目标是在世界各地创立相似的代码中心,建立地球代码银行(Earth Bank of Codes)
    这一帝业想要成功,需要付出巨大努力。
    许多问题有待解决。
    对于基因质量标准,不同属种标准不一样。
    人们还需要研究至今被忽视的有机体。
    分享生物资源的国家们(比如亚马逊流域,分散在9个国家)应该协调公共储藏库问题。
    还有政府必须抵制冶炼工业的游说与利益诱惑,保护土地、矿物、树林等。
    至于资金问题,也是双方在达沃斯论坛上宣布联手推动该计划的初衷。
    在来自世界的风云人物(也是超富有人物)面前挥舞着自己的讨钱罐,
    EBP已获得1亿美元融资,
    而代码银行则激怒了巴西与秘鲁政府历届政协主席魔龙在世。处男证。
    如果EBP计划成功的话,对于Lewin和Kress教授来说,将能够利用基因组之间的演化联系,给真核细胞生命历程下定义。
    这将能够为生物学家提供生物周期表,(类似于为化学家提供的元素周期表),也就是说为生物研究提供一个清晰的框架。
    Juan也能够据此为生物科技的国际贸易制定规则。
    如果未来真如许多人所猜测的那样,生物学演变成一种工业,就像化学和物理学所变成的工业一样,那绝对会是一场旷世伟业...
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    诶!感想太复杂!一时难以说清!
    人类好伟大!
    但是十世转生 ,我们不属于那一群!很难接受自己只是衬托这件事肇源贴吧 !
    诶!
    跑步去了88!